Se han reportado 80 especies de orquídeas en la Reserva, la mayoría del grupo de los Pleurothalidos. Estas plantas se caracterizan por sus diminutas flores que presentan adaptaciones para atraer a insectos polinizadores. Sus flores pueden imitar la forma y/o el aroma de la pareja del insecto polinizador, sirviendo así como uno de los métodos de engaño más sofisticados en la naturaleza.

La Reserva posee la orquídea mas pequeña de la isla (Lepanthopsis microlepanthes) reportada la primera vez por uno de los mas importantes investigadores de orquídeas, el destacado Donald Dod, quien colectó y describió cerca de un 30% de las especies de orquídeas de La Española.